Уточнение структуры винпоцетина методом РСА

Наталья Валерьевна Словеснова, Павел Александрович Слепухин, Анастасия Владимировна Рыбакова, Игорь Сергеевич Ковалев, Александр Юрьевич Петров, Юлия Мударисовна Сайфутдинова, Екатерина Алексеевна Кудряшова, Татьяна Александровна Поспелова, Дмитрий Сергеевич Копчук, Григорий Васильевич Зырянов

Аннотация


В рамках работы выполнено уточнение структуры полусинтетического алкалоида винпоцетина методом РСА с более низким значением фактора расходимости (R-фактора) по сравнению с ранее описанным в литературе. При этом кристалл винпоцетина был получен путем медленного упаривания его раствора в метаноле. По данным РСА фрагмент линеарной системы тетрагидрокарболина молекулы винпоцетина характеризуется выходом атома азота N(2) гидри-рованного пиридинового цикла из общей плоскости остальных атомов на 0,653 Å. В свою очередь ангулярная тетрагидропиридо[1,2-a]индольная система отличается выходом из её плоскости атомов углерода С(13) и С(14) на 0,806 и 0,327 Å соответственно. Ещё один шестичленный цикл расположен относительно тетрациклической системы индоло[3,2,1-de][1,5]нафтиридина под углом 83,9° и имеет конформацию кресла. В настоящей работе уточнены торсионный угол связей С(12)-С(13)-С(14)-С(15) (–85,5°) и ориентация этильного заместителя, характеризующаяся соответствующим торсионным углом С(14)-С(13)-С(18)-С(19) (67,65°). Основным структурным мотивом организации молекул в кристалле является формирование двойных лент вдоль оси b посредством слабых водородных связей типа С-Н…О (расстояние D-H…A 2,66 Å, DHA 121°, расстояние D…A 2,27 Å).


Ключевые слова


винпоцетин; РСА; уточнение; алкалоид

Полный текст:

PDF

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.