Уточнение структуры винпоцетина методом РСА

Наталья Валерьевна Словеснова
Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ; Уральский федеральный университет

Павел Александрович Слепухин
Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН Уральский федеральный университет

Анастасия Владимировна Рыбакова
Южно-Уральский государственный университет

Игорь Сергеевич Ковалев
Уральский федеральный университет

Александр Юрьевич Петров
Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ;Уральский федеральный университет химик-аналитик Циклотронного центра ядерной медицины ФТИ

Юлия Мударисовна Сайфутдинова
Уральский федеральный университет

Екатерина Алексеевна Кудряшова
Уральский федеральный университет

Татьяна Александровна Поспелова
Уральский федеральный университет

Дмитрий Сергеевич Копчук
Уральский федеральный университет

Григорий Васильевич Зырянов
Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН; Уральский федеральный университет


Аннотация


В рамках работы выполнено уточнение структуры полусинтетического алкалоида винпоцетина методом РСА с более низким значением фактора расходимости (R-фактора) по сравнению с ранее описанным в литературе. При этом кристалл винпоцетина был получен путем медленного упаривания его раствора в метаноле. По данным РСА фрагмент линеарной системы тетрагидрокарболина молекулы винпоцетина характеризуется выходом атома азота N(2) гидри-рованного пиридинового цикла из общей плоскости остальных атомов на 0,653 Å. В свою очередь ангулярная тетрагидропиридо[1,2-a]индольная система отличается выходом из её плоскости атомов углерода С(13) и С(14) на 0,806 и 0,327 Å соответственно. Ещё один шестичленный цикл расположен относительно тетрациклической системы индоло[3,2,1-de][1,5]нафтиридина под углом 83,9° и имеет конформацию кресла. В настоящей работе уточнены торсионный угол связей С(12)-С(13)-С(14)-С(15) (–85,5°) и ориентация этильного заместителя, характеризующаяся соответствующим торсионным углом С(14)-С(13)-С(18)-С(19) (67,65°). Основным структурным мотивом организации молекул в кристалле является формирование двойных лент вдоль оси b посредством слабых водородных связей типа С-Н…О (расстояние D-H…A 2,66 Å, DHA 121°, расстояние D…A 2,27 Å).


Ключевые слова


винпоцетин; РСА; уточнение; алкалоид

Полный текст:

PDF

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.