Уточнение структуры винпоцетина методом РСА

Авторы

  • Наталья Валерьевна Словеснова Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ; Уральский федеральный университет
  • Павел Александрович Слепухин Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН Уральский федеральный университет
  • Анастасия Владимировна Рыбакова Южно-Уральский государственный университет
  • Игорь Сергеевич Ковалев Уральский федеральный университет
  • Александр Юрьевич Петров Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ;Уральский федеральный университет химик-аналитик Циклотронного центра ядерной медицины ФТИ
  • Юлия Мударисовна Сайфутдинова Уральский федеральный университет
  • Екатерина Алексеевна Кудряшова Уральский федеральный университет
  • Татьяна Александровна Поспелова Уральский федеральный университет
  • Дмитрий Сергеевич Копчук Уральский федеральный университет
  • Григорий Васильевич Зырянов Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН; Уральский федеральный университет

Ключевые слова:

винпоцетин, РСА, уточнение, алкалоид

Аннотация

В рамках работы выполнено уточнение структуры полусинтетического алкалоида винпоцетина методом РСА с более низким значением фактора расходимости (R-фактора) по сравнению с ранее описанным в литературе. При этом кристалл винпоцетина был получен путем медленного упаривания его раствора в метаноле. По данным РСА фрагмент линеарной системы тетрагидрокарболина молекулы винпоцетина характеризуется выходом атома азота N(2) гидри-рованного пиридинового цикла из общей плоскости остальных атомов на 0,653 Å. В свою очередь ангулярная тетрагидропиридо[1,2-a]индольная система отличается выходом из её плоскости атомов углерода С(13) и С(14) на 0,806 и 0,327 Å соответственно. Ещё один шестичленный цикл расположен относительно тетрациклической системы индоло[3,2,1-de][1,5]нафтиридина под углом 83,9° и имеет конформацию кресла. В настоящей работе уточнены торсионный угол связей С(12)-С(13)-С(14)-С(15) (–85,5°) и ориентация этильного заместителя, характеризующаяся соответствующим торсионным углом С(14)-С(13)-С(18)-С(19) (67,65°). Основным структурным мотивом организации молекул в кристалле является формирование двойных лент вдоль оси b посредством слабых водородных связей типа С-Н…О (расстояние D-H…A 2,66 Å, DHA 121°, расстояние D…A 2,27 Å).

Биографии авторов

Наталья Валерьевна Словеснова, Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ; Уральский федеральный университет

ассистент кафедры фармации; младший научный сотрудник кафедры органической и биомолекулярной химии

Павел Александрович Слепухин, Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН Уральский федеральный университет

кандидат химических наук, руководитель группы РСА; младший научный сотрудник

Анастасия Владимировна Рыбакова, Южно-Уральский государственный университет

кандидат химических наук, доцент, доцент кафедры теоретической и прикладной химии

Игорь Сергеевич Ковалев, Уральский федеральный университет

кандидат химических наук, ведущий научный сотрудник Лаборатории перспективных материалов

Александр Юрьевич Петров, Уральский государственный медицинский университет Минздрава РФ;Уральский федеральный университет химик-аналитик Циклотронного центра ядерной медицины ФТИ

доктор фармацевтических наук, профессор кафедры фармации; химик-аналитик Циклотронного центра ядерной медицины ФТИ

Юлия Мударисовна Сайфутдинова, Уральский федеральный университет

инженер-исследователь кафедры органической и биомолекулярной химии ХТИ

Екатерина Алексеевна Кудряшова, Уральский федеральный университет

инженер-исследователь Лаборатории органического синтеза НОиИЦ ХФТ ХТИ, Уральский федеральный университет

Татьяна Александровна Поспелова, Уральский федеральный университет

кандидат химических наук, ведущий специалист кафедры технологии органического синтеза ХТИ

Дмитрий Сергеевич Копчук, Уральский федеральный университет

кандидат химических наук, ведущий специалист кафедры технологии органического синтеза ХТИ 

Григорий Васильевич Зырянов, Институт органического синтеза имени И.Я. Постовского УрО РАН; Уральский федеральный университет

доктор химических наук, профессор РАН, ведущий научный сотрудник Лаборатории координационных соединений; профессор кафедры органической и биомолекулярной химии ХТИ


Загрузки

Опубликован

2025-06-29