ИЗУЧЕНИЕ РЕГУЛЯТОРНЫХ МЕХАНИЗМОВ БИОСИНТЕЗА ВТОРИЧНЫХ МЕТАБОЛИТОВ ASPERGILLUS FLAVUS С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИНСТРУМЕНТОВ БИОИНФОРМАТИКИ

Ирина Юрьевна Потороко, Алена Александровна Руськина, Артем Владимирович Малинин

Аннотация


На сегодняшний день исследование рисков контаминации зернового сырья токсигенной микрофлорой, в частности микромицетами вида Aspergillus flavus и его вторичными метаболитами, в числе которых Афлатоксин В1, является актуальным направлением для глубинного изучения возможности минимизации рисков продуктов переработки зерна. Возможности инструментов биоинформатики позволяют на уровне прогнозирования раскрыть механизмы технологий обеззараживания и определить уровень воз-действия процессов обеззараживания для блокирования рисков. Цель данного исследования заключалась в изучении генов (aflR, aflJ, aflS, LaeA, VeA, rtfA) вторичных метаболитов токсигенного микромицета вида Aspergillus flavus для оценки основных регуляторных механизмов биосинтеза афлатоксинов и влияния на экспрессию генов активных форм кислорода (АФК) с применением инструментов биоинформатики (UGENE, AlphaFold Server, ProtParam). Было установлено, что исследование влияния активных форм кислорода (АФК) на экспрессию генов применимо для понимания механизмов устойчивости зернового сырья к риску контаминации плесневыми грибами и накоплению афлатоксинов при экстремальных климатических условиях. При анализе генома Aspergillus flavus было выявлено 56 ген-кластеров, которые кодируют различные ферменты, необходимые для биосинтеза вторичных метаболитов, включая афлатоксины, циклопиазоновую кислоту и афлатрем. Взаимосвязь геномной и структурной информации с физико-химическими свойствами критически важны для понимания патогенеза, устойчивости Aspergillus flavus и разработки методов контроля и создания эффективных способов обеззараживания зернового сырья, что имеет прямое значение для обеспечения продовольственной безопасности и здоровья потребителя применительно к продовольственному и фуражному зерну.

Ключевые слова


Aspergillus flavus; гены вторичных метаболитов; АФК; экспрессия генов; геномная аннотация; зерно пшеницы.

Полный текст:

PDF

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.